Oslobađanje Sjena Tomb Raidera dogodilo se s gotovo jedva vidljivim. Igra je doslovno više od iste Uspon Tomb Raider ali odluči konačno završiti trilogiju nove Lare Croft. Za one koji se pitaju kako se sve to završava, ovaj članak će objasniti kraj.

Jezgra centara za igru ​​pronalazi skriveni hram koji se nalazi u peruanskoj džungli. Sve počinje s Lara Croft i njezinom prijateljicom Jonah koja istražuje ruševine u Srednjoj Americi. Nakon što Lara dobije rijetki bodež prije nego što ga doktor Pedro Dominguez i ostatak Trojstva mogu nabaviti, aktivira se tsunami i selo se uništava. Dr. Dominguez uspijeva nabaviti bodež i odleti u Peru kako bi pronašao skriveni grad.

Lara i Jonah pokušavaju pobijediti Trinity u grad, ali njihov zrakoplov pada u oluji, a pilota se pojede živog i rastrga ga jaguars koji jedu čovjeka.

Lara i Jonah uspijevaju pobjeći iz jaguar den nakon što Lara ubije dvije zvijeri, a zatim pomaže nekoliko mještana prije nego što pobjegne od Trojstva do mjesta iskopavanja u skrivenom hramu.

Lara se provlači kroz Trinityjev logor i otkriva da im je glavni plan regrutirati je u stado i od Lare dobiti sve potrebne informacije u vezi s Richardom Croftom, svojim ocem.

Uz pomoć mještana po imenu Abby Ortez, Lara i Jonah prolaze kroz gustu peruansku džunglu i ulaze u srce skrivenog hrama.

Usput otkrivaju da Trinityjeve plaćenike lovi drugo kanibalsko pleme.

Lara nadilazi kušnje duhovnih vodiča kako bi napredovala dalje u Skriveni grad Paititi, što ju vodi u svadljivi susret između kulturnjaka i nekih seljana.

Lara spašava jednog od seljana, za kojeg se ispostavi da je sin kraljice Unuratu, vođe pobunjenika za stanovnike Paititija.

U gradu Lara otkriva da se dr. Pedro Dominguez zapravo zove Amaru, a izvorno je odrastao u Paititiju. Ispostavilo se da je Amaru/Dominguez bio brat Unuratuina muža, koji je ubijen.

Dr. Dominguez planira povratiti drugi artefakt, kutiju, kako bi izvršio žrtvu na vrhu hrama kako bi mogao preoblikovati svijet.

Kraljica Unuratu predvodi pobunjenike protiv Trojstva, koji su stoljećima bili prisutni u Paititiju i u tim su krajevima poznati kao "kultisti". Oni su u osnovi verzija Templara s niskom cijenom najma Assassin Creed.

Kultisti su tijekom stoljeća žrtvovali tijela kako bi zadovoljili bogove.

Kultist uhvati Unuratuova sina, ali Lara pomaže da ga oslobodi samo da bi Unuratu bio uhvaćen. Dublje u džunglu nailazi na još jedan skriveni hram unutar skrivenog grada u kojem se nalazi kutija. Međutim, kutiju čuvaju neki kanibali - ista ona bića koja su ubijala Trojice vojnike, poznate kao Yaaxil.

Kad Lara pokuša doći do kutije, otkriva da ona nedostaje. Ispostavilo se da je misiju misionar ukrao nekoliko stotina godina u prošlosti i sakrio izvan Paititija kako bi spriječio Trinity da pristupi kutiji.

Pokušavajući izvršiti upad u staru kraljevu grobnicu tražeći još jedan trag kako bi obnovio sunce i spriječio Trinity da preoblikuje svijet, kraljicu Unuratu ubija zapovjednik Rourke.

Unurato povjeri Lari da osigura da Etzli postane zakoniti nasljednik Paititi.

Jonah i Lara pokušavaju pronaći tragove u malom gradu u Peruu. Međutim, dvojac biva napadnut od strane helikoptera.

Nakon nasilnog ponašanja Trinitija, s Lara koja prolazi kroz psihotični poremećaj PTSP-a i ubija sve u rafineriji, i Jonah i Lara napokon stižu do kršćanske misije i konačno otkrivaju mjesto kutije.

Jonah i Lara preuzimaju kutiju, Ix Chel, ali Dominguez i Rourke uspijevaju ukrasti kutiju od njih, uzrokujući odron u selu.

Dominguez također otkriva Lari tijekom njihova susreta da joj je ubio oca jer je njezin otac bio na rubu da otkrije Paititi i da vanjski svijet putuje u skriveni grad, što Dominguez nije mogao dopustiti.

Lara se vraća u Paititi i radi s vođom kanibala, Crimson Fire, kako bi zaustavila zapovjednika Rourkea. Žena vođa kanibala ubija Rourkea jer je očito, žena namjeravala ubiti ravnog, bijelog muškarca.

Lara pronalazi Domingueza i suočava se s njim prije nego što završi ceremoniju, ubivši ga u tom procesu. U svojim umirućim riječima, Dominguez kaže Lari da zaštiti Paititi, što je zapravo sve što je pokušavao učiniti.

Lara ima zadatak vratiti sunce Paititiju tako što će postati bog, ona to čini apsorbirajući snagu noža. Vođa Yaaxila, Crimson Fire, uzima nož i pokušava ubosti Laru kao žrtvu. Nož ipak ne ubode Laru, a umjesto toga iz njezina tijela izbija bijela svjetlost.

Nakon što je spasila Paititi, Lara im pomaže u obnovi, a zatim se vraća kući u svoju kuću gdje joj poslužitelj poslužuje čaj. Kako scena nakon kreditiranja blijedi, dobivamo snimku starog crteža od kada je Lara bila dijete, pokazujući piramidu s dinosaurusom, što se odnosi na uskrsno jaje na izvornu trilogiju iz ere PSX-a.

TL; DR: Dr. Pedro Dominguez odrastao je u tajnom, drevnom selu poznatom kao Paititi. Bio je odsječen od ostatka svijeta. Postojala su proročanstva da će selo jednog dana biti uništeno. Nakon što je rastao oko svijeta, Dominguez se brinuo da će jednog dana kolonizatori, prirodne katastrofe ili osvajači uništiti Paititija, pa se osjećao prisiljenim ispuniti još jedno proročanstvo o preoblikovanju svijeta kako bi zaštitio Paititija i njegov narod od vanjskog svijeta. Za to je potrebna posebna kutija i mitski bodež.

Lara Croft pokušava zaustaviti Domingueza jer ne želi da on preoblikuje svijet, a surađuje s dvije plemenske kraljice kako bi srušila njegove ljude, ubila Domingueza i sama dovršila ritual. Igra završava tako da Lara uživa u životu u svojoj vili nakon što je prouzročila veliko uništenje i smrt Paititiju.